I rischi professionali per i pescatori sono  di tipo chimico, fisico, biologici ed ergonomici.

I rischi chimici sono dovuti all'utilizzo di detersivi, solventi, acidi usati nella pulizia dei locali; contatto con oli minerali per la manutenzione dei motori; inalazione di gas e vapori; inalazione di fibre di asbesto usato come coibente.

I rischi fisici sono essenzialmente il rumore generato dai motori,  le vibrazioni prodotte  sia dai motori che dal moto ondoso, le radiazioni non ionizzanti dovute alla esposizione alla luce solare diretta o riflessa dal mare, alle radiazioni infrarosse e ultraviolette ed anche alle radiofrequenze e microonde generate dalle apparecchiature elettroniche di bordo.

I rischi biologici possono derivare dal contatto diretto con alcune specie di pesci che possono produrre irritazioni cutanee

Importanti sono i rischi ergonomici dovuti a ritmi di lavoro intensi, pause inadeguate, posture incongrue e movimentazione di carichi.